引言分享一个刚发布不久的配色 R 包 poisonfrogs（毒蛙）：顾名思义，它的灵感来源于一系列受 新热带毒蛙 启发的色彩调色板。超过 200 种色彩鲜艳的物种，新热带毒蛙用生…

引言在单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据分析中，如何从高维、稀疏且充满噪声的数据中提取出具有生物学意义的信息，一直是困扰研究者的难题。传统的降维方法（如 PCA）往往容…

引言2025 年 5 月，中国药科大学生命科学与技术学院 周君，刘晓敏 课题组在 Journal of Biological Chemistry (JBC) 期刊发表文章 YTHD…

引言gghic 是一个用于创建灵活、适合发表的 3D 基因组组织数据可视化 R 包。使用 gghic，您可以轻松探索和展示 Hi-C/-接触图、拓扑关联域（TADs）、染色质环、基…

引言jjAnno 是我三年前写的一个简单的工具，来给 ggplot 周围添加不同的注释图形。本质上是使用 annotation_custom 来实现的。最近 ggplot 4.0.…

引言有时候只想看看基因的结构，没有其他信号数据输入什么的。简化版的 transcript_plot 来干这个事情。参数大部分和 coverage_plot 一致。devtools:…

引言 omicScope 最近我自己用的时候也是挺顺手的，我需要绘制几个基因的基因组的可视化表达情况，使用 coverage_plot 绘制的时候发现…

引言有用户在使用了 omicScope 的 coverage_plot 提了建议，然后进行了补充和优化。支持 bigwig 数据。显示 UTR 区域。高亮显示特定区域。安装 Ins…

好像什么也没干转眼2025年的十月份即将结束这一年曲曲折折不知说给谁好像没人能懂有哭泣、有难过有感动，也有笑容擦擦眼泪，继续前行打不败我的只会使我更强大 暑假决定给自己放放假于是买…

引言把 GDSC2 的不同药物和细胞系的 IC50 信息及基因表达谱信息作为内置数据放在 omicScope 里，可以直接绘制相关性散点图来查看特定药物特定基因的表达信息和 IC5…