小明的数据分析笔记本
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跟着Science正刊论文学数据分析:R语言做Kruskal-Wallis秩和检验
推荐的理由:没有太复杂的数学公式,都是一些简单的小例子,配有一些有趣的插图。涉及到的算法有排序、递归、哈希表、动态规划等等,内容还挺多的。动态规划在生物信息学的序列比对中是非常常用…
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卖核桃:买核桃送公众号23年9月到24年9月关于R语言做数据可视化的代码和示例数据
又到了一年一度卖核桃的节目 我老家在河北遵化,听地名大家可能不太熟悉,但是说 慈禧 大家可能知道,慈禧死后埋在了清东陵,最后被孙殿英盗墓的地方就在遵化。之前看《明朝那些事儿》,里面…
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用R语言包geneviewer可视化基因的共线性关系
https://nvelden.github.io/geneviewer/articles/geneviewer.html这个是用来画基因簇和转录本结构的,用来展示共线性关系也非常…
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R语言拆分数据框里的列
用emapper去做功能注释,gene id 和对应的GO格式如下gene01 GO:001,GO002gene02 GO:001,GO002,GO003需要把这个格式转换成下面的…
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R语言里做缺失值数据处理的R包——naniar
这个R包的帮助文档https://cran.r-project.org/web/packages/naniar/vignettes/getting-started-w-naniar…
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R语言批量做单因素方差分析并作柱形图和误差线图
用R语言里自带的PlantGrowth数据集做测试构造一个多变量的数据集PlantGrowth %>%select(2,1) %>%rename(“A…
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卖核桃:买核桃送公众号23年9月到24年9月关于R语言做数据可视化的代码和示例数据
又到了一年一度卖核桃的节目 我老家在河北遵化,听地名大家可能不太熟悉,但是说 慈禧 大家可能知道,慈禧死后埋在了清东陵,最后被孙殿英盗墓的地方就在遵化。之前看《明朝那些事儿》,里面…
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R语言批量做t检验
参考链接https://rforpoliticalscience.com/2024/03/24/how-to-run-multiple-t-tests-in-a-function-…
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R语言包EGAD用来评估基因共表达网络的表现(2)准备自己的数据
EGAD 这个R包的安装需要用到bioconductor,设置国内镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/bioconductor/…
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全基因组关联分析(GWAS)后使用机器学习算法+显著位点+表型做基因组预测
论文 Integrative genomics reveals the polygenic basis of seedlessness in grapevinehttps://do…