推荐几个单细胞在线分析网站

最近在跑单细胞数据验证课题思路,但是不想用R和Python写代码跑数据,然后有些数据也比较大,不方便在自己电脑上跑,于是就找了一些单细胞在线分析网站,发现了几个还不错的工具,分享给大家。
Cellenics

图片
图片

https://scp.biomage.net/


首推Cellenics,牛逼、快速且免费,前几天发现的,一开始都没抱有期待,因为之前有看到曾老师说这个公司的软件连使用方法都是收费的(https://mp.weixin.qq.com/s/2YdN05Z8P_cGHPcDjNG6xw)。但是后来发现和同类网站相比,他的文件上传速度特别快,而且分析数据的速度绝对吊打一堆网站。然后我又查了一下相关资讯,Parse Biosciences已经收购了Biomage,号称将大幅缩短单细胞数据分析时间(https://mp.weixin.qq.com/s/rbJV4X-AZ3hxnW9E4T1ObQ),这个真的很赞!

<<< 左右滑动见更多 >>>
这么好的网站,不知道为什么免费给大家使用,有可能过段时间就要收费了吧,但是最近有单细胞分析需求的可以去试试。(User Guide也写得很详细:https://www.biomage.net/user-guide) #但是我的另一台电脑打不开这个网站??
SCTK-QC

https://sctk.bu.edu/app/SingleCellTK
单细胞天地之前推荐过:https://mp.weixin.qq.com/s/WOq9k8b8D-wyBo_ZD_bAyg
Granatum

http://granatum.eecs.umich.edu:38101/?state_id=961da4d4f727854b&tab=info
还有这个也可以试试。
写在文末

前段时间还看到一篇发表在nature methods上的文章,使用GPT-4进行单细胞亚群注释(https://mp.weixin.qq.com/s/fKZVW1DpmnwLRCFi_KMTVg)
相信未来这些分析的门槛也会越来越低,大家可以适当关注一下前沿的工具,万一刚好用上了呢。

阅读原文


作者简介: 分享一些个人的生信学习笔记和公共卫生相关的一些知识以及人生经历,记录美好生活。公众号对我而言就像是另一个朋友圈,生活中的小惊喜是不可预料的,所以小分享也十分随机。欢迎你的关注鸭,我们一起好好学习、热爱生活奥!微信公众号:繁尘的bio小本本

声明:文中观点不代表本站立场。本文传送门:https://eyangzhen.com/414310.html

联系我们
联系我们
分享本页
返回顶部