植物基因表达综合数据库–涵盖147种植物的最大规模注释基因表达资源库

链接
https://peo.ku.dk/

数据库首页

在搜索框里输入基因ID,可以给出

组织特异性 (这里SPM是什么指标之前还没有见过)

不同组织的表达

mapman 和pfam注释

与这个基因共表达的基因

整体来看还挺好用,有大豆的表达数据,用的是v4版本的基因组

暂时还没有见到数据库对应的论文

开发团队是哥本哈根大学的

Assoc. Prof. Marek Mutwil
His group works on predictive, mechanistic and evolution-aware plant gene function, organised around three pillars:
Gene function prediction (graph-grounded AI and knowledge graphs), Stress resilience, and the Evolution of regulatory circuits.

前几天的推文
挖掘转录组“宝矿”新利器!Nature子刊:TEA-GCN,让杂乱数据精准指向功能基因

这个工具是他们团队开发的

他们团队的主页

https://publish.obsidian.md/mutwillab/Homepage/README

声明:来自小明的数据分析笔记本,仅代表创作者观点。链接:https://eyangzhen.com/8343.html

小明的数据分析笔记本的头像小明的数据分析笔记本

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