小明的数据分析笔记本
-
PlantCAD2:被子植物跨物种功能注释的长上下文DNA语言模型安装测试
论文 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.08.27.672609v4 PlantCAD2: A Long-Context D…
-
机器学习小例子:TabPFN回归模型
这个模型框架发表在Nature正刊上（之前竟然没有关注到），论文 https://www.nature.com/articles/s41586-024-08328-6 Accura…
-
机器学习模型小例子：xgboost回归模型预测血压/shap模型解释
最近在看 机器学习 shap分析相关的内容，在论文 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2590346225003…
-
跟着Nature学数据分析:SV数据构建进化树（NJ树）
论文From genotype to phenotype with 1,086 near telomere-to-telomere yeast genomes https://ww…
-
跟着Nature学数据分析：GWAS分析前对表型数据进行标准化转换（基于秩次的逆正态变换）
论文From genotype to phenotype with 1,086 near telomere-to-telomere yeast genomes https://ww…
-
跟着NAR学数据分析:群体重测序SNP数据划分不同单倍型
https://academic.oup.com/nar/article/54/5/gkag134/8500555Glycine max Jumonji C domain…
-
使用cropgbm基于snp和表型训练机器学习模型做基因组预测
cropgbm 的论文https://link.springer.com/article/10.1186/s13059-021-02492-yLightGBM: accelerat…
-
突破“着丝粒枷锁”！泛基因组研究揭示全着丝粒植物如何用染色体“碎片化”策略，重塑减数分裂重组格局
在生命演化的长河中，染色体的大规模重排（如融合、断裂）通常是致命的。这背后，是单着丝粒生物无法逾越的“着丝粒枷锁”——一旦关键结构被破坏，细胞分裂便陷入混乱。然而，有一类特殊的生物…
-
跟着Nature正刊学数据分析:酵母1086nearT2T论文中图形泛基因组部分的分析(1)
From genotype to phenotype with 1,086 near telomere-to-telomere yeast genomeshttps://www.n…
-
论文：局部适应与古人类基因渗入共同塑造了人类结构变异位点的全球多样性
论文https://elifesciences.org/articles/67615Local adaptation and archaic introgression shape…
