引言有时候只想看看基因的结构，没有其他信号数据输入什么的。简化版的 transcript_plot 来干这个事情。参数大部分和 coverage_plot 一致。devtools:…

引言 omicScope 最近我自己用的时候也是挺顺手的，我需要绘制几个基因的基因组的可视化表达情况，使用 coverage_plot 绘制的时候发现…

引言有用户在使用了 omicScope 的 coverage_plot 提了建议，然后进行了补充和优化。支持 bigwig 数据。显示 UTR 区域。高亮显示特定区域。安装 Ins…

好像什么也没干转眼2025年的十月份即将结束这一年曲曲折折不知说给谁好像没人能懂有哭泣、有难过有感动，也有笑容擦擦眼泪，继续前行打不败我的只会使我更强大 暑假决定给自己放放假于是买…

引言把 GDSC2 的不同药物和细胞系的 IC50 信息及基因表达谱信息作为内置数据放在 omicScope 里，可以直接绘制相关性散点图来查看特定药物特定基因的表达信息和 IC5…

引言走一个酒精性脂肪性肝病（NAFLD）肝脏的单细胞基因表达谱的上下游分析。GSE 编号为 GSE270583，四个样本。 原始数据下载使用 aspera 下载原始 fastq 文…

引言 免疫浸润分析是指通过计算生物学方法，量化肿瘤组织或其它病变组织中各种免疫细胞的比例和活性。这些浸润的免疫细胞共同构成了“肿瘤微环境”，它们不仅是机体对抗肿瘤的“前线战场”，也…

引言有时候大家可能会直接去 UCSC xena 数据库下载对应癌种表达数据自学分析和绘图。这也是需要较为繁琐的代码操作。omicScope 直接可以整合分析这些数据，一键分析和绘图…

引言除了对指定基因进行展示，对于表观相关的数据，可能需要展示特定基因组区间的信号分布情况。增加了这项功能。参考文档：https://junjunlab.github.io/omic…

引言如果直接是基于 bam 文件分析的，除了差异分析或者 boxplot 之类的图形展示基因的表达情况，还可以在基因组上进行展示，加入了基因不同 exon 的表达情况。这不需要将 …