老俊俊的生信笔记
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绿山·GreenHill花艺|南京毕业季鲜花预定开启
(老俊俊的好朋友刚开的花店,优惠多多,样式多样好看,感谢大家鼎力支持!🙏🙏🙏) 一束鲜花,致热烈又难忘的青春告别校园,奔赴下一场山海 超多好看又上镜的毕业花束已全部打样备好搭学士服…
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Bioconductor 最新发布的 94 个 R 包
引言这里的列表涵盖了 2026 年新发布的 Bioconductor 软件包,展示了生物信息学在单细胞多组学、空间转录组学、临床风险建模和蛋白质组学等领域的新工具。 https:/…
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如何不切换 R 版本安装大于 R 版本的 R 包?
引言我们有时候还在用稍微老一些的 R 版本,比如 R4.1/4.2,无论是在服务器和本地电脑上。而一些新出的和着更新的 R 包可能会限制 R 的版本,只有在大于或等于 R 包指定的…
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预售一张五年后的电影票,主角是你!
引言这是一封寄往未来的信,写信人是你,收信人是五年后的你。在 2025 年即将结束的最后一刻,让我们一起许下一个关于未来的约定。在 评论区 写下你的梦想、目标,或是想对 2030 …
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写给五年后自己的一些话(赶紧报名!)
之前不是在群里聊过这个话题嘛 我现在收集一下大家对于五年后 想对自己说的话 我在公众号12.31号会整理好并发布出来 然后五年后我会再发一条这个 看看五年后大家会是个什么状态和样子…
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scATAC-seq 多样本整合分析
引言之前我介绍过 signac 官网的 scATAC 多样本整合。里面是一个样本一个样本分析的,比较繁琐,这里我写一个批量分析的流程,明白易懂,可以给分析减少很多繁琐的操作和代码。…
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听说你还在为 SCI 配色困扰?
引言分享一个刚发布不久的配色 R 包 poisonfrogs(毒蛙):顾名思义,它的灵感来源于一系列受 新热带毒蛙 启发的色彩调色板。超过 200 种色彩鲜艳的物种,新热带毒蛙用生…
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新工具 CellMentor:基于监督式 NMF 的单细胞数据降维与整合利器,精准识别稀有细胞群
引言在单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)数据分析中,如何从高维、稀疏且充满噪声的数据中提取出具有生物学意义的信息,一直是困扰研究者的难题。传统的降维方法(如 PCA)往往容…
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YTHDF2 通过 DUX-ZSCAN4 分子回路抑制小鼠胚胎干细胞中的 2C 样状态
引言2025 年 5 月,中国药科大学生命科学与技术学院 周君,刘晓敏 课题组在 Journal of Biological Chemistry (JBC) 期刊发表文章 YTHD…
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gghic 分析可视化 Hi-C 数据
引言gghic 是一个用于创建灵活、适合发表的 3D 基因组组织数据可视化 R 包。使用 gghic,您可以轻松探索和展示 Hi-C/-接触图、拓扑关联域(TADs)、染色质环、基…