
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老俊俊的生信笔记
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ClusterGVis shiny 交互式 web 来了?
引言 ❝ClusterGVis 发布到现在已经有 3 年 多了,也是我写的第二个最受大家喜欢的 R 包,感谢大家这么久以来的支持和捧场。虽然代码写的很烂,但是最起码能完成一些事情,…
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Nature Methods 2025 年 1 月 22 卷 第 1 期
引言 ❝Nature Methods 2025 年 1 月 22 卷 第 1 期 文章速递。了解最新前沿科研动态。 ❝对齐单细胞轨迹来自两个不同数据集的细胞在时间和空间上对齐的概念…
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使用 python 来制作 shiny App
引言 ❝之前我介绍过一些 R 里面的关于 shiny 的知识分享,自己也写过几个制作的 shiny 包,后面在 python 中也开发了类似于 shiny 的框架,Shiny fo…
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Cell|Nature|Science 期刊10年封面一览
引言 ❝Science/Cell/Nature 期刊 每年的每月期刊杂志封面 经过编辑团队精心挑选和设计,所选内容是一般代表了当期最具影响力的研究方向或重大发现。 这里选取了 20…
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单细胞格式转换工具一文掌握!
引言 ❝单细胞分析现在分为两大派系,R 用户和python 用户,很多分析的工具也是基于这两种语言进行开发的。我们在分析的过程中,使用不同的工具进行分析就会涉及到相应的格式转换,单…
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CNS 科研高质量图形鉴赏(三)
引言 ❝继续科研绘图高质量图形鉴赏的系列三,话不多说,直接开干。让我们开始学习大佬们的优秀作品吧。human sensory neurons organoid ❝2024 年 11…
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我在远方给你烧纸钱
早上,我妈说村里一个小伙的父亲得了癌症,治了一两年,今天在家里死掉了。需要送点人情钱。怎么说呢,生老病死是人生常态吧,也许早点死去才是一种解脱,不必被疾病困扰了。有些人明明还年轻,…
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非模式生物单细胞亚群类型注释
引言 ❝非模式生物单细胞亚群注释参考数据库局限,缺乏完整的基因注释信息和 marker 基因数据库。若基因组注释不完善,可能还需要自己重头组装新的完整的基因组来做后续的分析。除了去…
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CNS 科研高质量图形鉴赏(二)
引言 ❝科研绘图高质量图形鉴赏的系列二,我看第一期效果挺好,然后继续分享这个系列。让我们开始学习大佬们的优秀作品吧。hdWGCNA ❝hdWGCNA,这是一个全面的框架,用于分析高…
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pyscenic 构建自己的 cisTarget 数据库
引言 ❝pyscenic 分析除了需要我们自己的表达矩阵文件,此外还需要 转录因子名称,转录因子到 motif 的注释文件 和 基因的 motif 富集信息 三个文件。官网只提供了…