引言 ❝Science/Cell/Nature 期刊 每年的每月期刊杂志封面 经过编辑团队精心挑选和设计，所选内容是一般代表了当期最具影响力的研究方向或重大发现。 这里选取了 20…

引言 ❝单细胞分析现在分为两大派系，R 用户和python 用户，很多分析的工具也是基于这两种语言进行开发的。我们在分析的过程中，使用不同的工具进行分析就会涉及到相应的格式转换，单…

引言 ❝继续科研绘图高质量图形鉴赏的系列三，话不多说，直接开干。让我们开始学习大佬们的优秀作品吧。human sensory neurons organoid ❝2024 年 11…

早上，我妈说村里一个小伙的父亲得了癌症，治了一两年，今天在家里死掉了。需要送点人情钱。怎么说呢，生老病死是人生常态吧，也许早点死去才是一种解脱，不必被疾病困扰了。有些人明明还年轻，…

引言 ❝非模式生物单细胞亚群注释参考数据库局限，缺乏完整的基因注释信息和 marker 基因数据库。若基因组注释不完善，可能还需要自己重头组装新的完整的基因组来做后续的分析。除了去…

引言 ❝科研绘图高质量图形鉴赏的系列二，我看第一期效果挺好，然后继续分享这个系列。让我们开始学习大佬们的优秀作品吧。hdWGCNA ❝hdWGCNA，这是一个全面的框架，用于分析高…

引言 ❝pyscenic 分析除了需要我们自己的表达矩阵文件，此外还需要 转录因子名称，转录因子到 motif 的注释文件 和 基因的 motif 富集信息 三个文件。官网只提供了…

引言 ❝FileZilla 是一个桌面端的服务器连接工具，可以下载或者上传数据。但是网速最好的时候也只能在 1M/s 左右。对于大数据文件而言无疑是非常缓慢的。这里我们介绍使用 s…

引言 ❝单细胞和单核 RNA 测序中存在普遍的环境 RNA 污染问题,会导致基因表达水平的偏差，影响分析结果。环境 RNA 指的是在单细胞 RNA 测序过程中，存在于细胞外溶液中的…

引言 ❝SCENIC (Single-Cell Regulatory Network Inference and Clustering) 是一种专门用于单细胞 RNA 测序数据的计…