pdb数据库

蛋白质数据库 (Protein Data Bank,PDB) 是一个国际性、综合性的蛋白质三维结构数据库

蛋白质数据库(PDB)在1971年建立,这是一个专门存储蛋白质、核酸等生物大分子三维结构的数据库,为全球科研工作者提供了极其宝贵的科研资源。该数据库不仅包括了生物分子的结构数据,同时还提供了关于这些结构如何测定的详细信息,例如通过X射线晶体学、核磁共振(NMR)或冷冻电镜等技术获取的数据。

PDB数据库,即蛋白质结构数据库(Protein Data Bank),是国际上最著名和最完整的蛋白质三维结构数据库,自1971年创建以来,已成为生物信息学领域内不可或缺的资源。PDB数据库不仅包含了蛋白质的三维结构信息,还包括了蛋白质的分类数据库如SCOP和CATH,这些数据库帮助研究者对蛋白质结构进行分类、检索和分析。

PDB数据库的应用非常广泛,它不仅可以帮助科学家们通过数据挖掘发现蛋白质序列和结构之间的联系或规律,还能促进对蛋白质序列决定结构机理的深入理解,进而寻找更好的蛋白质二级结构预测方法。此外,PDB数据库的数据对于新药开发、疾病机理研究等都具有极其重要的价值。

PDB数据库的发展历史悠久,从20世纪60年代对蛋白质结构的理论研究,到如今,PDB已经成为全球蛋白质结构研究的重要基础。随着科学技术的发展,PDB数据库的数据量不断增加,为蛋白质结构预测和功能研究提供了丰富的信息资源。

值得注意的是,除了PDB,还有如PDBj这样的数据库,由日本蛋白质数据库运营,是国际蛋白质数据库组织wwPDB的成员之一,提供了蛋白质的”形状”数据供全球研究者使用。

此外,还有一个名为PDB的药物综合数据库,由中国医药工业信息中心开发,专注于整合药品和医药企业相关的信息资料与数据,包括药品研发、生产、流通等各个环节。这个数据库为医药行业的研究和分析提供了重要的数据支持。

PDB数据库是蛋白质结构研究的重要工具,无论是在基础科学研究还是在医药开发领域都扮演着关键角色。

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