RiboProfiler: 关于我和 Ribo-SEQ 的不解之缘

1引言

RiboProfiler 是我对 Ribo-SEQ 数据分析工作的一个总结和理解,目前对于 Ribo-SEQ 数据分析的也是鱼龙混杂,国内乃至能做的公司都屈指可数,毕竟不是大流,做的人少,自然不是资本家逐利的追求了。学习的最好方法就是阅读一些好的文献,取其精华,理解并消化,最好能转化给自己所用。

不过在这匆忙的人生中,谁又能静下心去深耕呢,大概是跟着一篇差不多的教程,跑跑流程就好,我亦是如此,叹其水平有限,只能对强者望其项背而。关于 RiboProfiler, 自己后面也会用着来分析数据,所以整理整理代码,pack 一下,然后分享。


你也可以看看公众号的菜单关于ribo-seq之前的一些推文:

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2安装

# install.packages("devtools")
devtools::install_github("junjunlab/RiboProfiler")

# or
remotes::install_github("junjunlab/RiboProfiler")

library(RiboProfiler)

3文档

https://junjunlab.github.io/RiboProfiler-manual/
图片

4workflow

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5结尾

路漫漫其修远兮,吾将上下而求索。


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