小明的数据分析笔记本
-
大豆Cell论文中泛基因家族分析复现三：核心和泛基因家族曲线
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867420306188Pan-Genome of Wild and …
-
大豆Cell论文中泛基因家族分析复现二：不同类别基因家族比例饼图和频率柱形图
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867420306188Pan-Genome of Wild and …
-
大豆Cell论文中泛基因家族分析复现一：下载示例数据
泛基因组相关的论文中通常都会有这个分析，这个是一个标准化的分析，通常也不会有新的发现。在最开始的泛基因组论文里这个分析可能会放一个主图，最近的论文里基本上都是把这个分析放到附图里了…
-
R语言ggplot2做堆积柱形图展示密码子偏向性RSCU值（更新版）
之前有一篇推文记录过画图的代码R语言ggplot2画堆积柱形图展示密码子偏向性的RSCU值，R语言ggplot2画分组堆积柱形图展示密码子偏向性的RSCU值那篇推文里需要借助pyt…
-
大麦泛基因组(pan-genome)论文,分析泛基因组的代码都有,很好的学习泛基因组分析的材料
论文 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.14.580266v1Adaptive diversification thr…
-
跟着Science正刊论文学数据分析:R语言做Kruskal-Wallis秩和检验
推荐的理由：没有太复杂的数学公式，都是一些简单的小例子，配有一些有趣的插图。涉及到的算法有排序、递归、哈希表、动态规划等等，内容还挺多的。动态规划在生物信息学的序列比对中是非常常用…
-
卖核桃：买核桃送公众号23年9月到24年9月关于R语言做数据可视化的代码和示例数据
又到了一年一度卖核桃的节目 我老家在河北遵化，听地名大家可能不太熟悉，但是说 慈禧 大家可能知道，慈禧死后埋在了清东陵，最后被孙殿英盗墓的地方就在遵化。之前看《明朝那些事儿》，里面…
-
用R语言包geneviewer可视化基因的共线性关系
https://nvelden.github.io/geneviewer/articles/geneviewer.html这个是用来画基因簇和转录本结构的，用来展示共线性关系也非常…
-
R语言拆分数据框里的列
用emapper去做功能注释，gene id 和对应的GO格式如下gene01 GO:001,GO002gene02 GO:001,GO002,GO003需要把这个格式转换成下面的…
-
R语言里做缺失值数据处理的R包——naniar
这个R包的帮助文档https://cran.r-project.org/web/packages/naniar/vignettes/getting-started-w-naniar…
