小明的数据分析笔记本
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使用plink软件利用Fisher精确检验关联基因型和表型(GWAS)
最近看论文 Genetic subdivision and candidate genes under selection in North American grey wolve…
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跟着NC学数据分析:R语言用分子距离/环境距离/地理距离做mantel检验
论文 Genomic insights into local adaptation and future climate-induced vulnerability of a ke…
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生物信息学入门之~linux操作系统入门(视频版)
生物信息学入门必须掌握的一个基本技能是学会linux操作系统的使用。如果自己课题组有服务器器当然最好,直接找师兄师姐或者专门的管理员开通账号就可以了。如果课题组没有,获取linux…
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R语言做生态位分化分析(4)结果保存到本地自己作图
之前发过的关于生态位分化分析的推文R语言做生态位分化分析(3)一个真实的小例子R语言做生态位分化分析(2)找找参考论文R语言里做生态位分化分析(1)背景知识查询这个生态位分化分析整…
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用R语言的ggplot2包复现一下Nature正刊论文中的气泡图
论文 Temporal dynamics of the multi-omic response to endurance exercise traininghttps://www.…
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用R语言的circlize包复现一下Microbiome期刊中的圈图
论文 Heritability and recursive influence of host genetics on the rumen microbiota drive bod…
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R语言把otu表格的绝对丰度转换为相对丰度
otu表格的格式是每行是一个微生物,每列是一个样本,如下截图 image.png相对丰度就是 在这个样本中微生物的绝对丰度除以这个样本中所有微生物绝度丰度的和用R语言的tidyve…
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R语言做生态位分化分析(2)找找参考论文
做这个分析用到的R包是 ENMtools,用到的函数是 identity.test()之前有一篇推文记录的是学习一下背景知识R语言里做生态位分化分析(1)背景知识查询找找做这个分析…
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对符号秩检验简单小例子R语言做双侧威尔克森(Wilcoxon)配对符号秩检验简单小例子
示例数据来源于论文A disease-associated gene desert directs macrophage inflammation through ETS2 htt…
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学习Nature Genetics论文中使用plink+EMMAX做GWAS分析的完整实例
今天推文的内容可以在阿里云服务器上完成(配置2核2G 40G存储)购买费用是99元一年,如果是完全新用户,现在是82一年。可以通过以下链接购买https://www.aliyun.…