小明的数据分析笔记本
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生物信息学入门~在购买的云服务器上安装anaconda3用于常用的软件安装
云服务器购买链接(复制链接电脑端打开)https://www.aliyun.com/daily-act/ecs/activity_selection?source=5176.115…
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R语言rMVP包做GWAS(全基因组关联分析)分析实例
本篇推文的示例数据来源于参考书 《Genome-Wide Association Studies》的第十章 A Practical Guide to Using Structura…
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跟着Nature学数据分析:minimap2+DeepVariant流程利用hifi数据检测snp和indel
Graph pangenome captures missing heritability and empowers tomato breeding代码链接 https://git…
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R语言做基因表达量和变异位点的关联分析eQTL
http://www.bios.unc.edu/research/genomic_software/Matrix_eQTL/runit.html表达数据来源于论文 Populati…
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使用R语言的phytools包在进化树上标记自己测序取样的样本
之前有一篇推文介绍了使用R语言的ggtree包做这个事儿,如何使用R语言ggtree包在进化树上标记自己取样测序的样本今天看到R包phytools也可以做这个事情,链接是 http…
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生物信息学入门~购买99元1年的云服务器用于练习linux系统使用
购买链接https://www.aliyun.com/daily-act/ecs/activity_selection?source=5176.11533457&userC…
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R语言ggplot2散点图如何使用更多的形状
R语言ggplot2如果要做散点图可以用自带的一些形状 如果想用其他形状,有一个R包是ggstar https://cran.r-project.org/web/packages/…
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有趣的数据可视化:R语言ggplot2包画云雨图展示不同地质时代恐龙的体长
数据来源 image.png读取数据对数据进行预处理 library(tidyverse) read_csv(“2024.data/20240421/data.csv&…
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生物信息学入门第一步~拥有自己的linux操作系统
学习生物信息学必须要掌握的一个技能是使用linux操作系统。因为大部分组学数据处理的软件都是在linux系统下开发的,如果要使用这些软件就必须要学会使用linux操作系统。 作为入…
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跟着Nature Genetics学作图:R语言ggplot2双Y轴散点折线图
Genome assemblies of 11 bamboo species highlight diversification induced by dynamic subgen…