小明的数据分析笔记本
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跟着Nature Genetics学作图:R语言ggplot2做簇状的堆积柱形图
论文 Pangenome analysis provides insight into the evolution of the orange subfamily and a ke…
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有意思的数据可视化:R语言ggplot2热图展示NBA12到21赛季冠军归属(西部球队)
这个链接里有很多有意思数据可视化例子,我看了一下有一部分的数据是可以下载的,我们可以用R语言试着复现一下这里的例子。 首先是我自己比较感兴趣的一个例子 热图展示NBA12到21赛季…
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eQTL分析中对转录组表达量的值进行分位数标准化和反正则转换
论文 Structural variants and short tandem repeats impact gene expression and splicing in bov…
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跟着PNAS学数据分析:泛基因组(pan-genome)分析核心基因组可变基因组大小
论文 Novel functional sequences uncovered through a bovine multiassembly graph 代码链接 代码是一个sna…
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跟着NatureEcology&Evolution学作图:R语言GGally包展示多变量两两相关系数
论文 The evolution of human altriciality and brain development in comparative context 数据代码 论…
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跟着Nature Communications学作图:R语言箱线图和拟合曲线展示泛基因组中的基因家族数量
论文 Chromosome-level assemblies of multiple Arabidopsis genomes reveal hotspots of rearrang…
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跟着NatureEcology&Evolution学作图:R语言smplot2画云雨图
论文 The evolution of human altriciality and brain development in comparative context 数据代码 论…
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泛基因组分析计算核心可变基因家族的kaks
泛基因组分析中通常会使用orthofinder去分析基因家族,将这些基因家族分为核心和可变、私有等,然后会算不同类别的基因家族的Ka/Ks的值,主要说明的问题就是核心基因家族相对比…
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跟着Nature Genetics学作图:R语言ggplot2箱线图展示不同类别基因家族核苷酸多样性
论文 Pangenome analysis reveals genomic variations associated with domestication traits in b…
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跟着Nature Genetics学作图:R语言ggplot2散点图展示主成分分析(PCA)的结果
论文 Pangenome analysis reveals genomic variations associated with domestication traits in b…