老俊俊的生信笔记
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使用 ggplot2 美化你的校准曲线
1引言 来自粉丝(弱小,可怜,又被嫌弃的路易李四)投稿,感谢粉丝分享。(如果你也想投稿分享知识,欢迎联系我!) 2正文 在两个月前,俊俊的 QQ 群里有人分享一个推送,想问一个校准…
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R 里面也能去接头了: Rfastp
1引言 众所周知, 很多二代测序的上游分析软件大部分使用都是 linux 里面运行的, 而下游统计分析和可视化又得切换到其它软件,这样确实有点不方便。比如上游的去接头软件…
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绘制渐变色三角形
1引言 思路类似于之前画的哪个渐变色梯形一样, createTrapezoid。把一个三角形按其中一个顶点为基础分割为 n 份三角形,计算对应的坐标再绘制出来即可。函数&…
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geom_markArrow 修饰你的单细胞图形
1引言 还知道 scRNAtoolVis 包怎么来的吗?最开始就是单纯给聚类图里加个小箭头,于是写了clusterCornerAxes 和 FeatureCornerAxes 函数…
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ClusterGVis 对接 monocle2 拟时序热图
1引言 五一是个好日子, 有的人放下手头紧张的工作,带着家人孩子,好好休息放松一下,有的人来一场说走就走的蜜月之行,有的人则是大喜之日。明天是我堂弟和本科老铁的大喜之日,在这里,真…
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在 R 里面调用 julia
1引言 你可能会用 vscode 写一些 julia 脚本,你也可能在 R 里面做一些后续的处理,这样在不同软件里切换可…
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听说你想给聚类图旁边加个细胞数量条形图?
1引言 看到一篇文章的聚类图旁边加了一个细胞亚群的数量的条形图,其实简单画两个图拼起来就可以了。这里介绍一下使用分面来画的方法。 中奖名单: 请上面中奖的人及时私信我,与我联系,发…
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如何给单细胞降维图例上添加亚群编号
1引言 做单细胞的同学也许会经常看到,降维图的图例有些是里面加上了亚群的数字编号,然后后面是亚群的名称。五个月前我写了一个函数重新画个图例来做这样的事情,见 听说你想添加亚群数字标…
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geom_arch2 绘制指定高度的弧线
1引言 ggplot2 里面的 geom_curve 函数可以绘制曲线,其中 curvature 参数控制弧线的弯曲度,但是你没法…
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geom_cross_axis 绘制交叉坐标轴
1引言 很久之前看到一篇文献里的散点图的坐标是交叉的,网上也有一些解决代码,不过用的不是很方便,教程也很少,比如 跟着 Nature microbiology 学画图~R…