老俊俊的生信笔记
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更换 Rstudio 图标
1引言 来自粉丝 路易李四 投稿,感谢粉丝分享。 2正文 今天跑完代码时候休息一下,突然想起来,何不给 Rstudio 换一个图标。因为 Rstudio 的图标…
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如何下载重复序列元件的注释信息
1引言 对于一些重复元件,它们在细胞的发育过程中也扮演着重要的作用,比如逆转座子对于胚胎的分化和发育至关重要,有时候我们通常需要对他们进行定量来做一些相关分析,那么我们就得获取它们…
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重复序列元件定量分析
1引言 前面讲到了怎么下载重复元件的基因组位置及注释信息,这里再分享两款专门对重复元件进行定量的两款软件 TEtranscripts 和 SQuIRE…
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蛋白亚定位工具集合
1引言 分享在线预测蛋白亚定位的工具集合,对于靶蛋白的亚定位进行预测,你也可以多结合几个工具的结果综合分析。其中包含了不同时间发表的软件及其在线网址。 2网站 太多了,有上百个了感…
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手把手教你绘制染色体结构图
1引言 上面这张图想必大家都见到过, 但是你有没有想过自己怎样去画一个这样的呢? 目前是有一些这样的包的,比如 Gviz, Idiogram…
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aPEAR 优雅的可视化通路富集结果
1引言 分享一个新包, aPEAR 使用网络图可视化富集结果,支持 clusterProfiler 包返回的结果,之前类似的图好像得用&nb…
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BSgenomeForge 一行代码轻松构建 BSgenome package
1前言 我后悔我失去的,我接受这样的结果,但我也不放弃再次去抓住这失去的,因为我不后悔。 2引言 以前想要自己构建一个特定基因组的 BSgenome 包是非常麻…
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走的太远,不要忘了初心
1引言 曾经看大话西游只会傻笑,等已是曲中人时,才能切身的理解:曾经有一份真诚的爱情放在我面前,我没有珍惜,等我失去的时候我才后悔莫及,人世间最痛苦的事莫过于此。 如果上天能够给我…
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听说你想画个 monocle3 的拟时序热图?
1引言 前面 ClusterGVis 可以支持对 monocle2 的时序热图: ClusterGVis 对接 monocle2 拟时序热图。但是官方对 monocle2 已经不再…
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RiboProfiler: 关于我和 Ribo-SEQ 的不解之缘
1引言 RiboProfiler 是我对 Ribo-SEQ 数据分析工作的一个总结和理解,目前对于 Ribo-SEQ 数据分析的也…