老俊俊的生信笔记
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优雅的使用 lattice 可视化单细胞
1引言 想必大部分可视化单细胞的绘图都是 ggplot 的,我们看看如果使用 lattice 来可视化单细胞。 2二维散点图 首先提取基因表…
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听说你想在 circlize 的环形热图里添加显著性?
1引言 一位绘图大佬问我怎么在 circos.heatmap 绘制的环形热图里添加显著性,大概整理了一下,下面分享一些思路。 2探索 你去看 circ…
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听说表达趋势你想分面展示?
1引言 网上看到一个基因聚类的热图,对不同组的基因进行分面展示,觉得可以用 ClusterGVis 来试试。提取一下聚类的数据,加个分组,然后画个折线图,再拼一…
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听说你想把多个样本的 GSEA 画在一起?
1引言 有粉丝提问, 如何把多个组/实验的同一条 GSEA 结果画在一个图里,这样可以查看不同实验条件该通路的变化情况。本质上就是提取多个通路的富集结果,合并一下数据,然…
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视觉盛宴
1引言 哈萨克族人民的热情,新疆哈密的壮丽风景至今令我难忘。在如此艰难的环境下,国家对于西部的开发确实投入了很多,在这片土地生存,你需要克服恶劣的环境和拥有坚毅的意志力。 感谢赛力…
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grid 里绘制连续型图例
1引言 原理很简单,就是绘制一系列连续的矩形,然后填充对应的颜色就好了。 具体代码文末贴出, 感兴趣的同学可以研究一下。 2安装 函数在 jjPlot 里面: …
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听说你要手搓一个 grid.xaxis2/grid.yaxis2?
1引言 grid 包里的 grid.xaxis/grid.yaxis 函数绘制的坐标轴提供可修改的参数较少,画出来的样子不太美观,自己用一些简单的图形…
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用 grid 手搓一个单细胞散点图+细胞数量条形图
1引言 之前使用 ggplot 包,结合分面的方法在两个 panel 里面绘制散点和条形图,操作还是有些繁琐和不便的,此外效果也和上图有点差距。见推文 听说你想给聚类图旁边加个细胞…
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获取字符串的长度和宽度
1引言 grid 包中使用 stringWidth/stringHeight 来获取字符串的宽度和高度。 2示例 想象我们要为一个字符串添加一个贴合的…
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哈喽,七夕快乐
七夕节 DOUBLE SEVENTH FESTIVAL 遇见 单纯的微笑 肆意的拥抱 最幸福的事 是在最美的时刻 遇见了你 写给现在和以后的自己,也送给你们 慢慢的,也会有更多的想…