老俊俊的生信笔记
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ggplot 绘制热图标注特定名称
1引言 简单的把 smartLabelAlignGrob 封装为 geom 图层 geom_marklabel,这样用 ggplo…
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2024 年
1引言 距离上一次记录已经过去三个多月了,蓦然回首,感觉好像经历了很多很多事,又好像都停留在三个多月前的昨天一样。时间在这每日的自我提醒与感叹中流逝。转眼就已经踏入了 2024 年…
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听说你只有富集表格还想画 GSEA 图?
1引言 首先感谢使用小伙伴的支持和点赞! 我们知道绘制图形是需要对应存储数据的对象的, clusterProfiler 的 gseGO/gseKEGG…
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给你的亚群添加编号
1中奖名单 以下是分享前三的小伙伴,请及时公众号后台联系,发送你的具体收货地址信息,或者微信联系我,预期不候! 2引言 单细胞亚群注释的细胞名称前面往往会有软件分群的结果,也就是前…
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ggSCvis 让你的单细胞可视化 gg 起来
1引言 之前写的 scRNAtoolVis 由很多单独的可视化函数组装起来的,并且收到了很多小伙伴的喜欢和点赞, 基本上每个函数都是属于提取数据再作图…
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easylift 基因组坐标轻松转换
1引言 分享个 R 包 easylift, 对不同基因组坐标进行转换。 2安装 3使用 创建一个测试基因组坐标: 读取转换间两个基因组坐标的 chain 文件,你也可以去…
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geom_genomicNestedZoom 放大视图
1引言 参照 circlize 里面的 nested zooming 功能,借鉴其可视化的方式,写成 geom 图层进行…
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听说你想给 pheatmap 添加感兴趣基因?
1引言 详细很多人都在用 pheatmap 这个包绘制热图,简单方便又快捷,但是面对基因名很多时,又想要标记部分基因,事情变得麻烦了起来,为此不得不转向 complexheatma…
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给 heatmap 添加显著性标记
1引言 群里有人问怎么在热图里面添加显著性标记, 之前关于 circlze 里面也做过类似的操作, 听说你想在 circlize 的环形热图里添加显著性?。于是对 geom_tra…
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连接线的高度控制
1引言 讲一下 arcLinksGrob/arcLinks2Grob 绘制连接线关于曲线高度的控制。 2安装 3讲解 这两个函数里都有个 curve.heigh…