老俊俊的生信笔记

引言 ❝相关介绍 Science 丨“千里姻缘一线牵”——蛋白质组装的秘密。德国海德堡大学的 Günter Kramer 和 Bernd Bukau 教授在 2021 年 Scie…

引言 ❝摘要： 这项研究调查了泛素结合酶 Rad6 在调节氧化应激期间翻译的作用。研究人员使用核糖体测序(Ribo-seq)和 RNA 测序来表征野生型(WT)和 rad6Δ 酵母…

引言 ❝ribo-seq 数据的质量对于后续的分析非常重要。一般在进行后续深入分析的时候都需要提前评估数据的质量是否符合常规 ribo-seq 的特征。分享一篇浙大毛原辉老师的文章…

引言 ❝核糖体暂停或停滞是指在蛋白质合成过程中，核糖体在 mRNA 上移动的速度减慢或暂时停止。这种现象可以由多种因素引起，以下是一些常见的原因：❝mRNA 结构：二级结构：mRN…

引言 ❝给前面文章复现的结果收个尾，差不多文章里大部分的生信图都复现的差不多了。学有所得，总之是花费了很多时间和精力的。之前的可以参看下面推文链接：Molecular Cell 文…

引言 ❝在 Molecular Cell 文章部分结果复现(续) 中我们计算了一些在 eIF5A 缺失条件下一些核糖体占据明显增多的三肽基序。 ❝接下来我们计算核糖体的 P/E 位…

引言 ❝2024 年 8 月 26 日，Nature Communications 上发表了一篇文章 Calibrated ribosome profiling assesses …

引言 ❝codon occupancy(密码子占有率) 指的是核糖体在不同密码子上停留的多少。反映了核糖体在特定密码子上的相对停留时间。高 occupancy 表示核糖体在该密码子…

喜欢我就快点关注我吧 1引言 此篇内容来自粉丝的投稿,感谢这位粉丝的分享!此外 俊粉投稿分享群 已成立,欢迎愿意分享的有志之士加入。 2内容 说到生存分析，相必大家想到的第一个都是…

引言 ❝复现 Molecular Cell 文章的部分结果。文章背景：论文探讨了翻译因子 eIF5A 在翻译延长和终止中的作用。通过利用核糖体剖析和体外生化实验,作者发现 eIF5…